De vondst hernieuwde het debat over de plaats van gigantische virussen op de evolutionaire boom. Zijn dit virussen of levende cellen die het vermogen hebben verloren om onafhankelijk te reproduceren?
Oostenrijkse microbiologen hebben een virus ontdekt dat zich onderscheidt van zijn verwanten in grootte en complexiteit van het apparaat. De "recordhouder", gevonden in het afvalwater van de stad Klosterneuburg in het oosten van Oostenrijk, heeft een diameter van ongeveer 400 nanometer en een genoomgrootte van 1.570 duizend basenparen (355 genen). Ter ere van de plaats van ontdekking werd het virus Klosneuvirus genoemd. De vondst wordt gerapporteerd door het tijdschrift Science.
Het virus werd gedetecteerd met behulp van een arsenaal aan metagenomics-methoden. Simpel gezegd, het genoom van het virus werd stuk voor stuk samengesteld uit de fragmenten die in de genomen monsters werden gevonden. Met deze benadering kunnen onderzoekers de set genen van alle micro-organismen die in de monsteromgeving aanwezig zijn, bestuderen zonder dat ze in het laboratorium worden gekweekt. De auteurs van het werk beoordelen de vondst zelf als een voldongen feit en rapporteren de waarschijnlijke ontdekking van drie verwante soorten in de nabije omgeving.
De ontdekking deed de discussie weer oplaaien of de gigantische virussen die de afgelopen anderhalf decennium periodiek zijn ontdekt, virussen zijn in de strikte zin van het woord, of dat we voormalige levende cellen hebben die ooit parasieten werden en op een lang evolutionair pad een behoorlijke hoeveelheid genetische informatie verloren, samen met die aanpassingen., die gecodeerd "verwijderd". In dit geval lijkt het logisch om ze in een apart domein te scheiden, gelijk aan bacteriën, eukaryoten en archaea.
Grootte van enkele bekende virussen: Poliomyelitisvirus ~ 30 nm. Zika-virus ~ 45 nm. Adenovirus ~ 90 nm. HIV-1 ~ 120 nm. Mimivirus ~ 400 nm
De meeste virussen zijn inderdaad veel kleiner dan de cellen waarin ze binnendringen, en hebben een zeer bescheiden omvang van genetisch materiaal. Sommige soorten vogel- en varkensvirussen kosten slechts twee genen om zich voort te planten, tegen duizenden van zelfs een gewone bacterie. De bekende E. coli bevat bijvoorbeeld 4400 genen - en dit is nog geen record. Bekende reuzenvirussen (de eerste werd ontdekt in 2003, en in totaal zijn er ongeveer een half dozijn beschreven) bevatten elk ongeveer een tot tweeduizend genen, wat duidelijk meer is dan het minimumaantal dat nodig is om een cel te 'vangen' en vervolgens te gebruiken. Sommige organismen, waarvan bekend is dat ze in staat zijn tot onafhankelijk leven en voortplanting, kosten minder.
Sceptici zien de noodzaak niet in van het vierde domein, dat de genetische redundantie van gigantische virussen verklaart door gastheermateriaal te lenen. Evgeny Kunin (National Center for Biotechnology Information, Bethesda, Maryland) noemt het bijvoorbeeld "glashelder" dat reuzenvirussen behoren tot groepen die veel kleinere vormen bevatten. Over het algemeen neigen de auteurs van de ontdekking zelf tot dit standpunt. Samen met collega's toonden ze aan dat gigantische virussen geleidelijk genetisch materiaal van verschillende gastheren leenden. "Er is geen bewijs voor een vierde domein, en dit document bevestigt het", zegt Curtis Suttle, een viroloog aan de University of British Columbia in Vancouver, Canada.
Bovendien twijfelen sceptici aan het feit van de ontdekking. Microbioloog Didier Raoult van de Universiteit van Marseille merkt op dat het leuk zou zijn om de eigenaar te zien voordat we conclusies trekken over evolutie op basis van het genoom. De volgorde van genen is zelf een ondergeschikt argument: ze wisselen vaak van plaats en ondergaan andere veranderingen die hun oorsprong maskeren.
Promotie video:
Sergey Sysoev
