Genetici hebben het genoom van de pestbacil ontcijferd, een bacterie die Europa in de 14e eeuw verwoestte. Het bleek dat de dodelijke peststok bijna niet te onderscheiden is van zijn onschadelijke "overgrootmoeder"
In augustus 2011 verkregen wetenschappers van universiteiten in de VS, Duitsland en Canada, onder leiding van Johannes Krause van de Universiteit van Tuebingen, de eerste gedeeltelijke gegevens over het DNA van de pestbacil Yersinia pestis, die in een periode van vijf jaar van de 14e eeuw 30 miljoen mensen heeft gedood. … Om dit te doen, bestudeerden genetici de botten en tanden van slachtoffers van de pest die in 1348 werden begraven op de East Smithfield Cemetery in Londen.
In een artikel van augustus hebben onderzoekers circulair DNA teruggevonden dat zich buiten de chromosomen bevindt en nodig is voor bacteriën om eiwitten te synthetiseren die de menselijke immuniteit onderdrukken. Deze DNA - plasmide pPCP1 - biologen vergeleken met vergelijkbare delen van het genoom in moderne peststokken, waarna ze tot de conclusie kwamen dat de pestbacil van de 14e eeuw uitstierf en geen nakomelingen achterliet.
In de laatste studie, waarvan de resultaten in Nature verschenen, gebruikten Dr. Krause en zijn collega's een reeds gevestigde techniek om het volledige genoom van Yersinia pestis samen te stellen.
Ze selecteerden verschillende goed bewaarde tanden uit de graven van East Smithfield. De resten van het bacteriële genoom werden gevonden op de kronen en wortels van tanden. De puzzel van vier miljoen nucleotiden van genetica werd samengesteld met behulp van een computerprogramma.
Zoals de onderzoekers opmerken, is de nauwkeurigheid van het decoderen van het Yersinia pestis-genoom hoog - vergelijkbaar met de nauwkeurigheid van het decoderen van het menselijk genoom.
Toegegeven, in het genoom van de dodelijke bacterie zijn er nog steeds witte vlekken: biologen hebben 93,5% van de genetische "puzzel" hersteld - de resterende delen zijn opgelost in het massagraf van East Smithfield.
Overgrootmoeder van de Zwarte Dood
Het team van Dr. Krause vergeleek de structuur van het resulterende DNA met het genoom van de moderne pestbacil (stam CO92). Het bleek dat de meeste genen in chromosomen en plasmiden samenvallen, maar sommige regio's zijn ofwel volledig afwezig in moderne bacteriën of zijn vervangen door andere DNA-sequenties.
Promotie video:
In het genoom van een middeleeuwse bacterie hebben wetenschappers ook genen ontdekt die de oudste stammen van Yersinia pestis combineren met hun gemeenschappelijke voorouder , de bacterie Yersinia pseudotuberculosis.
"Dit geeft aan dat het genoom van Yersinia pestis de afgelopen 600 jaar weinig is veranderd, ondanks verschillende epidemieën en actieve personen die ziekteverwekkers bestrijden", zeggen wetenschappers, die de resultaten van de vergelijkende analyse samenvatten.
